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相较于本科毕业论文而言，硕士毕业论文是100%需要通过知网查重的，一般而言，各校关于硕士毕业论文的查重率规定虽有所不同，但基本上都规定查重率不得超过10%-20%，这也意味着硕士毕业论文的知网查重率必须要更为严格的控制。 知网VIP5.3系统虽然较之于以前的知网查重系统进行了升级，但是其重复率计算规则仍然是按照连续十三字符以上重复计算为重复部分，这也意味着学生可以巧妙的利用该规则避免重复。
硕士要求的重复率一般不会高于20％，如果大于或者等于20％，小于30％者，疑似存在学术不端行为，取消优秀学位论文评选资格，限期修改进行复检。 初检的重复率如果大于或等于30％，之后复检大于或等于20％者，可能会被取消本次学位论文答辩资格。 结果在35％以上的同学，直接延期答辩，需要对论文重新进行修改。
硕士毕业论文查重一般要求的高一点，有的学校甚至要求3%内，并且还有单章复制比要求！ ！ ！ 1、大部分高校要求硕士论文的字数通常是在3万字以上，要求比较严格的会在7万字以上，并会规范论文的格式要求，原因之一就是为了论文检测时的结果能够准确无误。
经研究决定，将我校全日制硕士研究生学位论文的查重率由不超过30%调整为不超过20%（含20%），即全日制硕士研究生学位论文重复率超过20%的为不合格，不能进行论文答辩；在职工商管理硕士（MBA）和在职工程硕士研究生学位论文的查重率由不超过30%调整为不超过25%（含25%），即在职工商管理硕士（MBA）和在职工程硕士研究生学位论文重复率超过25%的为不合格，不能进行论文答辩。