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学术查重报告是把论文的原文和学术数据库当中已收录的论文形成比对，如果论文原文和学术数据库当中的论文具有很的相似度，且该部分没有被标注为引用部分，也就是说没有在论文当中加上脚注，则该部分会被识别为重复部分，而如果该部分加上了脚注，学术的数据库当中并没有相应的文献，那也是无效的脚注，加的其实是假脚注，明明用的是某个学者的论文，但是却标注成另外一个学者的名称，这样，学术就没有办法将该部分识别为引用部分。.
虽然学术查重系统对比其他系统已经非常之好了，但仍有可能发生。 所幸的是，几乎所有的评审机构对于重复率要求都是留有余量的。 所以再次声明，重复率余量不是默认可以抄袭的量，是留给引用和检测偏差的。
首先应当明确的是，学术查重并不是只要论文作者将论文的相关部分加上脚注，这样就会自动将该部分识别为引用部分，那学术究竟识别什么样的脚注才算是引用呢？ 其实学术是有大数据的，也就是说，学术查重报告是通过比对论文的原文和学术数据库当中的论文，如果，论文原文和学术数据库当中的论文具有高度相似性，且该部分没有被标注为引用部分，也就是说没有在论文当中加上脚注，则该部分会被识别为重复部分，而如果该部分加上了脚注，是在学术的数据库当中，并没有相应的文献，也就是说，所谓的加脚注，加的其实是假脚注，明明用的是某个学者的论文，但是却标注成另外一个学者的名称，这样，学术就没有办法将该部分识别为引用部分。