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首先，查重系统会将全篇论文和数据库进行对比。 从结果来看的话，如果是大段飘红的文字，那么就表示这些文字存在抄袭情况，大段的飘黄则说明这些文字是引用文献。 在进行检测的时候，查重系统会将论文以章节的形式来进行片段检测。
所以，正文内容不仅是占据了论文的主要篇幅，也是最重要的部分，是必须进行查重的。 不过，论文查重不仅限于论文的正文内容部分，对于论文的标题、摘要、引用等等也是必须要进行查重检测的。 毕竟，论文查重系统会把大家上传好的论文内容和数据库中所收录的资源进行一一比对。
二、毕业论文论文查重哪些部分. 首先一篇完整的毕业论文主要包括以下内容：封面、声明、中英文摘要、目录、主要符号对照表、正文、致谢、参考文献、附录、原创性声明或者授权声明、个人简历、导师简介、学习期间发表的学术论文等部分组成。. 其中正文部分，通常是由引文、摘要、各部分章节、总结等部分组成。. 大多数高校在每年毕业季时，都会统一发通知说明学校的毕业论文规范和查重说明，学校会统一下发论文样式等内容，一般会详细说明查重的范围。. 要是学校有具体的要求，那提交到学校的时候必须按照学校所要求的来哦。.
作为国内三大学术论文数据商（知网、万方、维普）之一，在论文检测市场中，知网是绝大多数高校和中文期刊定稿论文必用的查重系统，搜索量最大，万方次之，维普最小。 越来越紧的学术政策下，高校毕业论文或者杂志社的投稿期刊文章，都要首先经过知网学术不端系统的检测，只有查重比例合格了才能进入下一环节。