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会查的。
目录是由正文里的标题产生的，查正文的时候会查标题；
参考文献重复一些是没问题的，不能重复太多，比如90%都一样就不行。
查重的学术不端检测理论上是查正文，不过，系统并不智能，同样的文章不同次检测结果也不同。有时候，论文封面的标准格式、页码、参考文献、致谢、个人简历、在学期间学术成果等页面也会被查重，计入重复率百分比。所以，学校还要求大家对查重结果做说明，说明这些是非正文，不涉及学术观点
这个要看你学校具体要求的，你学校要检测哪些就上传哪些，尽量和学校查重内容保持一致，这样检测的才一致。不过目录和参考文献在学校查重系统可以识别的，只要你的格式正确，系统可以自动剔除不算重复的。查重可以直接到图书馆查重，也可以到一些知网自助查重网站：学术不端网、PaperEasy、蚂蚁查重网等，全程自助安全！快速！
学校用的知网，知网比较完善，他能够区分论文题目，小标题，引用内容。而且对比也是和同类型文章对比，不像paperpass是只要有一样的全是重复，根本不一种类型的文章也说是抄的，所以查的重复率特别高。你这个情况，应该是没有问题了。 不过最好是把红色部分再修改下
论文查重一般查重只需要查论文正文部分，参考文献，目录，摘要，封面不需要查重，具体要看所在学校的要求。如果在知网查重，如果格式正确，知网查重系统对目录内容是不计入查重字数的，也不计算重复率。
摘要属于论文的正文部分，只要放在论文中，知网查重系统一定会识别，进行查重。通常情况下，知网查重系统检测的部分包括：目录（要放在论文中提交，尽管系统不查重）、摘要（中文、英文）、正文、致谢、参考文献（道理同“目录”）。
扩展资料：
论文查重的原理：
论文查重先建立比对库，当有一个文章需要检测时，放入比对库进行检测，如果某一句、某段、或者整篇和对比库中的文章相似，就会视为重复给记录下来。整篇文章检测完毕之后，会根据之前记录的重复内容来生成比对文档。
比对文档通常是网页格式或PDF格式，比对文档中会有论文检测获得的相似比例、重复的内容所在、重复内容的来源文章。检测比对库里需要收录期刊、学位论文、会议论文、报纸、年鉴、工具书、专利、外文文献、学术文献引文等与科学研究、学习相关的主要资源。
论文检测需要搜索引擎技术作为支撑，包括资源采集技术，文本数据库加工技术，文本数据库技术,数字资源版权保护技术,知识挖掘技术,自然语言处理技术、快速比对技术等。在全文数据的基础上实现快速准确的检测，上述技术是基本的保证。
参考资料来源：百度百科-论文检测服务
其实关于论文查重主要还是看大家倾向于的什么样的查重方式写论文参考书籍如何查重了，因为选择的查重方式不同的话可以能出现的结果也是不同的现在目前的快速论文查重的方式也有两种，一种是直接通过论文查重软件进行查重，另一种是直接通过论文查重。